MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Dawn genome

Total Repeats: 7813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022760	TA	3	6	277699	277704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_022760	ATCT	2	8	277820	277827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_022760	GTT	2	6	281288	281293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_022760	GTA	2	6	281312	281317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_022760	TG	4	8	281360	281367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_022760	CGT	2	6	281372	281377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_022760	TAAA	2	8	281407	281414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_022760	N	171	171	282887	283057	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_022760	AAG	2	6	283108	283113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_022760	CTG	2	6	283148	283153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_022760	GTCT	2	8	283221	283228	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_022760	ATAG	2	8	283232	283239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_022760	CA	3	6	284483	284488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_022760	CTG	2	6	284654	284659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_022760	TGGGCT	2	12	284692	284703	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1516	NC_022760	CTG	2	6	284862	284867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_022760	TTG	2	6	284908	284913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_022760	ATCC	2	8	284917	284924	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_022760	CCT	2	6	284926	284931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_022760	CTTT	2	8	284938	284945	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_022760	CA	3	6	284955	284960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_022760	ACG	2	6	284977	284982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_022760	ACC	2	6	284998	285003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_022760	GAT	2	6	285055	285060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_022760	TGT	2	6	285098	285103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_022760	TTC	2	6	285124	285129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_022760	TAC	2	6	285201	285206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_022760	CAT	2	6	285272	285277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_022760	CAAG	2	8	285284	285291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_022760	N	1985	1985	285311	287295	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_022760	GTA	2	6	287333	287338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_022760	TGT	2	6	287348	287353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_022760	CG	3	6	287375	287380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_022760	GTT	2	6	287409	287414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_022760	CGC	2	6	288924	288929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_022760	ATGT	2	8	288969	288976	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_022760	AT	3	6	288983	288988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_022760	CCG	2	6	289375	289380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_022760	CCA	2	6	289624	289629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_022760	CTC	2	6	289644	289649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_022760	A	6	6	289693	289698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_022760	CA	3	6	289769	289774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_022760	CG	3	6	289785	289790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_022760	AGC	2	6	289822	289827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_022760	GC	3	6	289826	289831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_022760	AGC	2	6	289833	289838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_022760	CCTA	2	8	289892	289899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_022760	TTC	2	6	289905	289910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_022760	G	6	6	290168	290173	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_022760	T	6	6	290294	290299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_022760	TGC	2	6	290345	290350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_022760	TCCC	2	8	290395	290402	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1553	NC_022760	ATG	2	6	290407	290412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_022760	TTC	2	6	290445	290450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_022760	GCG	2	6	290457	290462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_022760	GTC	2	6	290486	290491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_022760	TGC	2	6	290523	290528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_022760	GT	3	6	290636	290641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_022760	TTC	2	6	290710	290715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_022760	GTT	2	6	290746	290751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_022760	GCCT	2	8	290763	290770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_022760	ATG	2	6	290809	290814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_022760	GGGTA	2	10	290942	290951	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_022760	GA	3	6	290954	290959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_022760	GCG	2	6	290962	290967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_022760	TTCTT	2	10	290968	290977	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1567	NC_022760	TGC	2	6	290999	291004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_022760	T	6	6	291541	291546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_022760	TGA	2	6	291624	291629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_022760	GGC	2	6	291680	291685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_022760	TG	3	6	291735	291740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_022760	TG	3	6	291840	291845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_022760	CAA	2	6	291884	291889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_022760	TG	3	6	291894	291899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_022760	CAA	2	6	291989	291994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_022760	CTG	2	6	292092	292097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_022760	TTA	2	6	292144	292149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_022760	TAT	2	6	292164	292169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_022760	GCC	2	6	292196	292201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_022760	GT	3	6	292373	292378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_022760	AGTTG	2	10	292421	292430	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_022760	ATG	2	6	292436	292441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_022760	TGA	2	6	292479	292484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_022760	CAC	2	6	292487	292492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_022760	TGT	2	6	292500	292505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_022760	GGA	2	6	292518	292523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_022760	TGG	2	6	292524	292529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_022760	GAGTT	2	10	292547	292556	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_022760	TTGC	2	8	292585	292592	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1590	NC_022760	GAT	2	6	292641	292646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_022760	TGT	2	6	292647	292652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_022760	CTG	2	6	292706	292711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_022760	AGG	2	6	292721	292726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_022760	CTT	2	6	292755	292760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_022760	GAT	2	6	292833	292838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_022760	TG	3	6	292879	292884	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_022760	CG	3	6	292942	292947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_022760	CTT	2	6	293007	293012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_022760	GTA	2	6	293144	293149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_022760	TGG	2	6	293151	293156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_022760	TGG	2	6	293163	293168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_022760	GCG	3	9	293176	293184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_022760	TGT	2	6	293187	293192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_022760	GAG	2	6	293209	293214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_022760	TGG	2	6	293217	293222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_022760	N	140	140	293239	293378	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_022760	G	9	9	293399	293407	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_022760	C	6	6	293430	293435	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1609	NC_022760	TGG	2	6	293441	293446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_022760	TGC	2	6	298014	298019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_022760	CAG	2	6	298119	298124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_022760	TTG	2	6	298157	298162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_022760	ATA	2	6	298177	298182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_022760	T	7	7	298185	298191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_022760	TTG	2	6	298290	298295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_022760	TTC	2	6	298493	298498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_022760	GT	3	6	298541	298546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_022760	G	6	6	298547	298552	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_022760	A	6	6	298605	298610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_022760	TTG	2	6	298708	298713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_022760	T	7	7	298725	298731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_022760	GAA	2	6	298815	298820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_022760	TTGT	2	8	298854	298861	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_022760	G	6	6	298952	298957	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_022760	CAA	2	6	299016	299021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_022760	T	7	7	299059	299065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_022760	T	6	6	299135	299140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_022760	TG	3	6	299223	299228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_022760	CAG	2	6	299624	299629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_022760	GT	4	8	299654	299661	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_022760	CTGC	2	8	299798	299805	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_022760	AGT	2	6	299831	299836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_022760	TC	3	6	299896	299901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_022760	T	6	6	299943	299948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_022760	CAG	2	6	300019	300024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_022760	TGGTG	2	10	300038	300047	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_022760	TG	4	8	300057	300064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_022760	TTA	2	6	300074	300079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_022760	TGCA	2	8	300154	300161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1640	NC_022760	GCT	2	6	300213	300218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1642	NC_022760	CTG	2	6	300251	300256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1643	NC_022760	CTTG	2	8	300280	300287	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1644	NC_022760	TAA	2	6	300294	300299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1655	NC_022760	GCT	2	6	300639	300644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1656	NC_022760	TGT	2	6	300650	300655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1658	NC_022760	CGATC	2	10	300899	300908	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1670	NC_022760	CGG	2	6	301359	301364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1671	NC_022760	TGT	2	6	301391	301396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1672	NC_022760	GC	3	6	301406	301411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1673	NC_022760	CGC	3	9	301419	301427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1674	NC_022760	CAG	2	6	301446	301451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1679	NC_022760	ATT	2	6	306370	306375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1767	NC_022760	GTA	2	6	309897	309902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1771	NC_022760	ATG	2	6	310063	310068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1773	NC_022760	CGT	2	6	310115	310120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1897	NC_022760	TAC	2	6	315997	316002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1905	NC_022760	ATC	2	6	316331	316336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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